产品货号:
YTB4183
中文名称:
Poly(A)聚合酶
英文名称:
E.coli Poly(A)Polymerase
产品规格:
100U|500U|2500U|10kU
发货周期:
1~3天
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E.coli Poly(A)聚合酶能以不依赖于模板的方式催化由ATP转化成的AMP添加到单链RNA的3’末端,以形成Poly(A)尾。E.coli Poly(A)聚合酶能以各种单链RNA作为底物RNA,但双链RNA及过短的寡核苷酸不推荐作为该反应的RNA底物,并且DNA不能作为该反应的底物。实测15nt合成的RNA完全可以作为E.coli Poly(A) Polymerase的底物,在ATP存在时催化形成Poly(A)尾的。E.coli Poly(A) Polymerase催化的Poly(A)加尾反应只能使用ATP,而不能使用ADP或dATP。另外,使用CTP和UTP时,其掺入量不足使用ATP时的5%;而使用GTP时,其完全不能添加到RNA的3'末端。
图1.本制品与N公司的同类产品对单链RNA加Poly(A)尾的对比效果图。在20μL反应体系(50mM Tris-HCl,pH8.1,250mM NaCl,1mM ATP,10mM MgCl2)中,加入人工合成的0.5μg 22nt的单链RNA,以及图中指定量的本制品或N公司的E.coli Poly(A) Polymerase,37℃孵育30min,65℃孵育20min终止反应。取出5μL反应后的产物,加入1μL 6×DNA上样缓冲液,95℃变性3min,然后进行含7M Urea的15%聚丙烯酰胺凝胶电泳。室温条件下用1×TBE作为电泳液,180V电泳90min,NadRed红色核酸染料1:1000稀释后室温染色30min,然后拍照观察。如图所示,本制品与N公司的产品相比,具有类似的对单链RNA加Poly(A)尾的效果。
用放射性同位素标记的ATP或虫草素(cordycepin)标记RNA;为RNA添加Poly(A)尾,用于反转录后克隆或亲和纯化;增加mRNA的稳定性,从而提高转染至真核细胞中的RNA的翻译效率。
重组E.coli菌株,携带克隆自大肠杆菌的Poly(A)聚合酶基因。
一个单位是指在20μL反应体系中,37℃条件下,10分钟内将1nmol AMP以掺入到RNA中所需的酶量。
组分 | 100U | 500U | 2500U | 10kU |
E.coli Poly(A)聚合酶(5U/μL) | 20μL | 100μL | 500μL | 2mL |
10×PAP Reaction Buffer | 50μL | 250μL | 1.25mL | 5mL |
10mM ATP | 50μL | 250μL | 1.25mL | 5mL |
保存:-20℃,有效期2年。
20mM Tris-HCl(pH7.5@25℃),500mM NaCl,1mM DTT,1mM EDTA,50% (v/v) Glycerol,0.1%(w/v) Triton X-100。
10×PAP Reaction Buffer:
500mM Tris-HCl(pH8.1@25℃),2.5M NaCl,100mM MgCl2。
不含DNase、RNase和磷酸酯酶。
加入EDTA至终浓度为10mM,或65℃加热20min。
- 反应缓冲液PAP Reaction Buffer中不包含ATP。
- E.coli Poly(A)聚合酶的用量主要影响目的产物的长度,可以根据所需目的产物的长度适当调整酶的用量,如果想得到长度较长的产物可以适当加大酶的用量或延长反应时间。
- 参考下表在冰浴中设置反应体系。参考下表20μL反应体系中加Poly(A)尾的RNA底物量可以高达10μg,并且可根据实验需要按比例放大反应体系。在Poly(A)加尾反应中,加尾的长度取决于RNA 3'-OH末端的摩尔浓度、反应时间、酶量和ATP浓度。可以通过更改一个或多个因素来调整加尾的长度。按照如下的推荐反应体系,在37℃孵育30min,加Poly(A)尾长度可以超过100个碱基。
成分 用量 终浓度 DEPC-treated Water (14.5-x)μL - 10×PAP Reaction Buffer 2μL 1× 10mM ATP 2μL 1mM RNase Inhibitor(40U/μL) 0.5μL 1U/μL(可选) RNA xμl 0.05~0.5μg/μL E.coli Poly(A)聚合酶(5U/μL) 1μL 0.25U/μL 总体积 20μL - - 由于涉及RNA操作,需要严格按照RNA操作的规范进行,避免RNase污染,相关试剂和耗材需要经过DEPC处理以去除RNase或者确保是RNase free的。
- 用于加尾反应的RNA在使用前应进行适当的纯化,并溶解于nuclease free water中,且溶液中应不含EDTA和盐分。
- 如果较难确保比较严格的RNase-free,推荐在上述反应体系中添加0.5μL RNase抑制剂,以提高溶液中RNA的稳定性。
- 由于涉及RNA操作,需要严格按照RNA操作的规范进行,避免RNase污染,相关试剂和耗材需要经过DEPC处理以去除RNase或者确保是RNase free的。
- 加尾反应:37℃孵育30min。
- 反应终止:加入EDTA至终浓度为10mM,或65℃加热20min以终止反应。
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